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No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
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21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
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28 | 1RCN | - | DA DT DA DA | n/a | n/a |
29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
35 | 3FL0 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
36 | 4WYP | Kd = 440 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
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39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
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47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
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52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
53 | 1WBU | - | WBU | C4 H5 N3 O2 | C1=C(C(=O).... |
54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
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56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
64 | 2W5L | Ki = 63 uM | NAP | C21 H28 N7 O17 P3 | c1cc(c[n+].... |
65 | 1RUV | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
73 | 1TQ9 | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
78 | 3DJQ | Ki = 1046.4 uM | UDP | C9 H14 N2 O12 P2 | C1=CN(C(=O.... |
79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
10 | 2W5I | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
11 | 3D8Y | Ki = 396 uM | T3S | C15 H23 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
12 | 3D6O | Ki = 77 uM | U1S | C17 H25 N3 O7 | CCOC(=O)C1.... |
13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
15 | 1RPF | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
16 | 3D6P | Ki = 179 uM | U2S | C13 H19 N3 O6 | C1COCCN1C[.... |
17 | 4G8V | Ki = 1.6 uM | 0EY | C12 H15 N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
18 | 1RNC | - | 5GP | C10 H14 N5 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
19 | 4WYZ | Kd = 50 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
20 | 1ROB | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
23 | 1O0F | Ki = 5 uM | A3P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
24 | 3EV4 | - | ETF | C2 H3 F3 O | C(C(F)(F)F.... |
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29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
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32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
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37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
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44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
45 | 1RNN | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
46 | 2XOG | Ki = 0.37 mM | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
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52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
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56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
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61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
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66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
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71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
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74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
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83 | 2RNF | - | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | T3P | 1 | 1 |
2 | THP | 0.753846 | 0.971014 |
3 | LLT | 0.629032 | 0.84507 |
4 | THM | 0.629032 | 0.84507 |
5 | TMP | 0.6 | 0.957143 |
6 | UM3 | 0.573529 | 0.955882 |
7 | FDM | 0.569444 | 0.917808 |
8 | NYM | 0.569444 | 0.930556 |
9 | 0DN | 0.560606 | 0.805556 |
10 | TYD | 0.56 | 0.943662 |
11 | ATY | 0.556962 | 0.917808 |
12 | AZZ | 0.549296 | 0.824324 |
13 | TBD | 0.545455 | 0.905405 |
14 | TTP | 0.531646 | 0.943662 |
15 | ATM | 0.525641 | 0.893333 |
16 | AZD | 0.506024 | 0.881579 |
17 | 2DT | 0.5 | 0.957143 |
18 | TXS | 0.5 | 0.763158 |
19 | TTP MG | 0.487805 | 0.915493 |
20 | T3S | 0.486842 | 0.763158 |
21 | DAU | 0.483516 | 0.905405 |
22 | TPE | 0.483516 | 0.868421 |
23 | 3DR DT DT DT DT DT | 0.479167 | 0.878378 |
24 | TLO | 0.477273 | 0.891892 |
25 | 9RC | 0.47191 | 0.804878 |
26 | 3YN | 0.462366 | 0.88 |
27 | 18T | 0.456522 | 0.88 |
28 | 1JB | 0.456522 | 0.88 |
29 | TRH | 0.456522 | 0.88 |
30 | 3R2 | 0.456522 | 0.868421 |
31 | TDX | 0.456522 | 0.891892 |
32 | ABT | 0.455556 | 0.858974 |
33 | D3T | 0.451219 | 0.943662 |
34 | DWN | 0.446809 | 0.857143 |
35 | T3Q | 0.446809 | 0.857143 |
36 | T3F | 0.446809 | 0.857143 |
37 | 0N2 | 0.442105 | 0.846154 |
38 | T46 | 0.442105 | 0.88 |
39 | 0FX | 0.4375 | 0.857143 |
40 | MMF | 0.4375 | 0.857143 |
41 | DT ME6 DT | 0.428571 | 0.844156 |
42 | QDM | 0.428571 | 0.846154 |
43 | ADS THS THS THS | 0.428571 | 0.755814 |
44 | FNF | 0.424242 | 0.868421 |
45 | JHZ | 0.424242 | 0.835443 |
46 | AKM | 0.424242 | 0.8375 |
47 | 1YF | 0.424242 | 0.868421 |
48 | DPB | 0.423529 | 0.902778 |
49 | PAX | 0.422414 | 0.82716 |
50 | 4TG | 0.42 | 0.868421 |
51 | 5HU | 0.417722 | 0.943662 |
52 | D4M | 0.410256 | 0.913043 |
53 | UFP | 0.405063 | 0.878378 |
54 | 0BT | 0.404494 | 0.855263 |
55 | WMJ | 0.402174 | 0.738095 |
56 | BRU | 0.4 | 0.878378 |
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|---|---|
1 | U3P | 0.9522 |
2 | 101 | 0.9498 |
3 | C3P | 0.9417 |
4 | UA3 | 0.9279 |
5 | 103 | 0.9245 |
6 | 3AM | 0.9189 |
7 | UMF | 0.9161 |
8 | A3G | 0.9156 |
9 | 3GP | 0.9095 |
10 | ACK | 0.9095 |
11 | QQX | 0.9039 |
12 | U2P | 0.9038 |
13 | UVC | 0.9003 |
14 | C2P | 0.8995 |
15 | SGP | 0.8971 |
16 | 2AM | 0.8965 |
17 | 2GP | 0.8927 |
18 | M0Y | 0.8890 |
19 | OVE | 0.8883 |
20 | IGP | 0.8869 |
21 | VM7 | 0.8863 |
22 | IAG | 0.8855 |
23 | 1FL | 0.8818 |
24 | D5M | 0.8813 |
25 | UMP | 0.8797 |
26 | G | 0.8746 |
27 | XTS | 0.8715 |
28 | BK2 | 0.8703 |
29 | 0DJ | 0.8698 |
30 | 1SF | 0.8697 |
31 | ADN | 0.8697 |
32 | AMP | 0.8690 |
33 | ZAS | 0.8685 |
34 | 4OZ | 0.8682 |
35 | GMP | 0.8675 |
36 | RVC | 0.8671 |
37 | 6MA | 0.8656 |
38 | XEV | 0.8653 |
39 | 21E | 0.8650 |
40 | M0Z | 0.8642 |
41 | Q4G | 0.8636 |
42 | MTA | 0.8635 |
43 | 5BX | 0.8633 |
44 | AQ1 | 0.8625 |
45 | 8OG | 0.8617 |
46 | Y3J | 0.8617 |
47 | PY1 | 0.8617 |
48 | MCY | 0.8607 |
49 | FX5 | 0.8605 |
50 | A3S | 0.8601 |
51 | EAE | 0.8593 |
52 | 28B | 0.8590 |
53 | 3AD | 0.8589 |
54 | 6F3 | 0.8583 |
55 | AV4 | 0.8569 |
56 | U4J | 0.8563 |
57 | Q92 | 0.8561 |
58 | C5P | 0.8561 |
59 | KWV | 0.8559 |
60 | AUV | 0.8555 |
61 | TVC | 0.8549 |
62 | ID2 | 0.8546 |
63 | AGV | 0.8542 |
64 | JMQ | 0.8542 |
65 | 7VF | 0.8542 |
66 | EZN | 0.8542 |
67 | MBY | 0.8531 |
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 1u1b.bio2) has 86 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
This union binding pocket(no: 2) in the query (biounit: 1u1b.bio1) has 79 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
1 | 2GMK | AMP | 40.3846 |