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No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
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13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
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21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
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28 | 1RCN | - | DA DT DA DA | n/a | n/a |
29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
35 | 3FL0 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
36 | 4WYP | Kd = 440 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
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48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
51 | 3RID | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
53 | 1WBU | - | WBU | C4 H5 N3 O2 | C1=C(C(=O).... |
54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
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56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
64 | 2W5L | Ki = 63 uM | NAP | C21 H28 N7 O17 P3 | c1cc(c[n+].... |
65 | 1RUV | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
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73 | 1TQ9 | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
78 | 3DJQ | Ki = 1046.4 uM | UDP | C9 H14 N2 O12 P2 | C1=CN(C(=O.... |
79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
10 | 2W5I | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
11 | 3D8Y | Ki = 396 uM | T3S | C15 H23 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
12 | 3D6O | Ki = 77 uM | U1S | C17 H25 N3 O7 | CCOC(=O)C1.... |
13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
15 | 1RPF | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
16 | 3D6P | Ki = 179 uM | U2S | C13 H19 N3 O6 | C1COCCN1C[.... |
17 | 4G8V | Ki = 1.6 uM | 0EY | C12 H15 N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
18 | 1RNC | - | 5GP | C10 H14 N5 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
19 | 4WYZ | Kd = 50 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
20 | 1ROB | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
23 | 1O0F | Ki = 5 uM | A3P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
24 | 3EV4 | - | ETF | C2 H3 F3 O | C(C(F)(F)F.... |
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29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
35 | 3FL0 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
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37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
43 | 6XHC | - | V2G | C12 H17 N6 O8 P | c1nc(c2c(n.... |
44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
45 | 1RNN | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
46 | 2XOG | Ki = 0.37 mM | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
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52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
55 | 4G8Y | Ki = 25.8 uM | 0FT | C13 H17 N5 O6 | CC1=CN(C(=.... |
56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
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66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
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74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
78 | 3DJQ | Ki = 1046.4 uM | UDP | C9 H14 N2 O12 P2 | C1=CN(C(=O.... |
79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
82 | 5ARK | - | UMP | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
83 | 2RNF | - | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | NAP | 1 | 1 |
2 | NA0 | 0.881356 | 0.986301 |
3 | TAP | 0.872881 | 0.934211 |
4 | NDO | 0.840336 | 0.972603 |
5 | NAD | 0.811966 | 0.986111 |
6 | N01 | 0.733871 | 0.958904 |
7 | NAD IBO | 0.716667 | 0.972222 |
8 | NAD TDB | 0.716667 | 0.972222 |
9 | A3D | 0.712 | 0.972603 |
10 | NBP | 0.707692 | 0.935065 |
11 | NHD | 0.68254 | 0.958904 |
12 | NJP | 0.661417 | 0.972973 |
13 | NFD | 0.658915 | 0.934211 |
14 | DND | 0.619048 | 0.959459 |
15 | AMP NAD | 0.606061 | 0.958904 |
16 | ZID | 0.605839 | 0.972603 |
17 | NAQ | 0.59854 | 0.922078 |
18 | ATR | 0.59292 | 0.917808 |
19 | NAE | 0.591241 | 0.946667 |
20 | NDE | 0.58042 | 0.986301 |
21 | A22 | 0.571429 | 0.958904 |
22 | NAJ | 0.567164 | 0.986111 |
23 | A2R | 0.563025 | 0.932432 |
24 | NDC | 0.561644 | 0.922078 |
25 | NA7 | 0.552846 | 0.907895 |
26 | ODP | 0.551471 | 0.935065 |
27 | A2P | 0.539823 | 0.930556 |
28 | 8ID | 0.537313 | 0.910256 |
29 | NAD BBN | 0.525974 | 0.865854 |
30 | NPW | 0.525547 | 0.8875 |
31 | NZQ | 0.521739 | 0.910256 |
32 | CNA | 0.521739 | 0.959459 |
33 | NAD CJ3 | 0.519231 | 0.835294 |
34 | NDP | 0.514493 | 0.922078 |
35 | PO4 PO4 A A A A PO4 | 0.503937 | 0.930556 |
36 | 1DG | 0.503401 | 0.922078 |
37 | DG1 | 0.503401 | 0.922078 |
38 | TXP | 0.5 | 0.922078 |
39 | NMN AMP PO4 | 0.492958 | 0.921053 |
40 | XNP | 0.492958 | 0.875 |
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42 | 25A | 0.492063 | 0.972222 |
43 | NAD NDT | 0.490909 | 0.747368 |
44 | NMN | 0.486726 | 0.888889 |
45 | NGD | 0.485714 | 0.935065 |
46 | 9JJ | 0.481707 | 0.8875 |
47 | 2AM | 0.477876 | 0.891892 |
48 | NDP DTT | 0.461538 | 0.843373 |
49 | ADP | 0.458333 | 0.945205 |
50 | ADP MG | 0.454545 | 0.944444 |
51 | ADP BEF | 0.454545 | 0.944444 |
52 | A7R | 0.452555 | 0.846154 |
53 | PAP | 0.451613 | 0.931507 |
54 | A2D | 0.445378 | 0.945205 |
55 | AN2 | 0.442623 | 0.932432 |
56 | 7L1 | 0.441558 | 0.777778 |
57 | ADP PO3 | 0.44 | 0.944444 |
58 | AGS | 0.44 | 0.896104 |
59 | ATP MG | 0.44 | 0.944444 |
60 | M33 | 0.439024 | 0.906667 |
61 | AR6 AR6 | 0.438849 | 0.945205 |
62 | BA3 | 0.438017 | 0.945205 |
63 | VO4 ADP | 0.4375 | 0.945946 |
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66 | ADP BMA | 0.43609 | 0.92 |
67 | DQV | 0.435714 | 0.958904 |
68 | HEJ | 0.435484 | 0.945205 |
69 | ATP | 0.435484 | 0.945205 |
70 | OOB | 0.435115 | 0.958904 |
71 | AP5 | 0.434426 | 0.945205 |
72 | B4P | 0.434426 | 0.945205 |
73 | GAP | 0.433071 | 0.92 |
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79 | HQG | 0.430769 | 0.932432 |
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82 | DAL AMP | 0.427481 | 0.932432 |
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140 | FA5 | 0.4 | 0.933333 |
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 1u1b.bio2) has 86 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
This union binding pocket(no: 2) in the query (biounit: 1u1b.bio1) has 79 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
1 | 2GMK | AMP | 40.3846 |