- Navigate
- Expand All | Collapse All
- Receptor | Ligand | View in 3D
- Family: 90% | 70% | 50% | site
- External Links
- |
- Download
- Structure Biounit | Ligand Information
- PDB : .ZIP | .CSV
- Family 90% : .ZIP | .CSV
- Class : .ZIP | .CSV
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 5 families. | |||||
1 | 1YXW | - | TYR GLU TRP | n/a | n/a |
2 | 3HN1 | - | SIA SIA | n/a | n/a |
3 | 1DIW | - | GAL | C6 H12 O6 | C([C@@H]1[.... |
4 | 5TPC | Kd = 1 mM | GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
5 | 2VU9 | - | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
6 | 3R4S | - | SLB | C11 H19 N O9 | CC(=O)N[C@.... |
7 | 3OBT | - | SLB | C11 H19 N O9 | CC(=O)N[C@.... |
8 | 3RSJ | - | GAL SIA NGA GAL SIA | n/a | n/a |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | BGC GAL SIA NGA GAL SIA | 1 | 1 |
2 | BGC GAL SIA NGA GAL | 0.917431 | 1 |
3 | GAL NGA GAL SIA | 0.895238 | 1 |
4 | BGC GAL GLA NGA GAL SIA | 0.849558 | 1 |
5 | GAL SIA NGA GAL SIA | 0.842593 | 1 |
6 | BGC GAL SIA NAG | 0.80531 | 1 |
7 | BGC GAL SIA NGA GAL FUC | 0.803279 | 1 |
8 | GAL NGA GAL SIA SIA | 0.789916 | 0.981132 |
9 | SIA GAL NGA GAL | 0.761062 | 1 |
10 | GAL SIA NGA GAL SIA SIA | 0.752066 | 0.981132 |
11 | BGC GAL SIA SIA | 0.737288 | 0.981132 |
12 | GLC GAL NGC | 0.723214 | 0.924528 |
13 | BGC GAL SIA NGA SIA | 0.716535 | 0.981132 |
14 | NAG GAL SIA | 0.705357 | 1 |
15 | A2G GAL SIA | 0.696429 | 1 |
16 | BGC CEQ GAL SLB NGA GAL SIA SIA | 0.693431 | 0.83871 |
17 | GAL SIA NGA GAL | 0.658333 | 0.981132 |
18 | NAG GAL NGC | 0.65 | 0.962264 |
19 | GAL NAG FUC GAL SIA | 0.645669 | 1 |
20 | GAL SIA NGA | 0.641026 | 1 |
21 | NAG GAL SIA SIA | 0.639344 | 0.981132 |
22 | NGS GAL SIA | 0.634146 | 0.787879 |
23 | NGA GAL SIA | 0.633333 | 0.980769 |
24 | NAG FUC GAL SIA | 0.624 | 1 |
25 | MAG FUC GAL SIA | 0.624 | 0.962264 |
26 | BGC GAL SIA | 0.613445 | 0.943396 |
27 | NDG GAL SIA SIA | 0.612903 | 0.945455 |
28 | BGC GAL NAG GAL SIA | 0.598485 | 0.981132 |
29 | BGC 18C GAL SIA NGA GAL | 0.593548 | 0.83871 |
30 | NGA POL GAL NGC AZI | 0.583333 | 0.784615 |
31 | NAG GAL PKM | 0.576 | 0.981132 |
32 | Z3Q GAL 5N6 | 0.568182 | 0.83871 |
33 | NGS FUC GLA SIA | 0.566176 | 0.787879 |
34 | NAG 2FG SIA | 0.552 | 0.928571 |
35 | 2FG SIA | 0.547826 | 0.892857 |
36 | GAL NAG GAL SIA | 0.542636 | 0.981132 |
37 | GAL 5N6 | 0.542373 | 0.962264 |
38 | GAL SIA SIA | 0.536585 | 0.981132 |
39 | BGC 16C GAL SIA | 0.530201 | 0.83871 |
40 | MBG NGC | 0.525424 | 0.907407 |
41 | NAG GAL NAG GAL SIA | 0.521739 | 0.981132 |
42 | CEQ BGC NGA GAL SIA SIA | 0.519737 | 0.8 |
43 | BGC 18C GAL SIA | 0.513158 | 0.83871 |
44 | BGC GAL NAG GAL | 0.491228 | 0.865385 |
45 | BGC GAL GLA NGA GAL | 0.487179 | 0.865385 |
46 | BGC GAL NGA GAL | 0.486726 | 0.865385 |
47 | NAG GAL 5N6 | 0.470588 | 0.962963 |
48 | BGC GAL NAG GAL FUC | 0.440945 | 0.884615 |
49 | GAL SIA | 0.433333 | 0.924528 |
50 | SIA CMO | 0.427273 | 0.87037 |
51 | BGC GAL NAG | 0.423729 | 0.865385 |
52 | C4W NAG FUC BMA MAN NAG GAL SIA | 0.418182 | 0.852459 |
53 | BGC GAL GLA NGA | 0.418033 | 0.865385 |
54 | BGC GAL NAG GAL FUC FUC | 0.416667 | 0.903846 |
55 | GLC GAL NAG GAL FUC GLA | 0.413534 | 0.884615 |
56 | GAL 1GN BGC ACY GAL 1GN BGC ACY GAL 6PZ | 0.412903 | 0.945455 |
57 | C4W NAG FUC BMA MAN MAN NAG GAL SIA NAG | 0.411429 | 0.852459 |
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 5tpc.bio1) has 13 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |