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No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
10 | 2W5I | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
11 | 3D8Y | Ki = 396 uM | T3S | C15 H23 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
12 | 3D6O | Ki = 77 uM | U1S | C17 H25 N3 O7 | CCOC(=O)C1.... |
13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
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18 | 1RNC | - | 5GP | C10 H14 N5 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
19 | 4WYZ | Kd = 50 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
20 | 1ROB | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
23 | 1O0F | Ki = 5 uM | A3P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
24 | 3EV4 | - | ETF | C2 H3 F3 O | C(C(F)(F)F.... |
25 | 1RCA | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
26 | 1RND | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
27 | 4RSK | Kd = 47.4 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
28 | 1RCN | - | DA DT DA DA | n/a | n/a |
29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
31 | 2W5K | Ki = 12 uM | NDP | C21 H30 N7 O17 P3 | c1nc(c2c(n.... |
32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
35 | 3FL0 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
36 | 4WYP | Kd = 440 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
43 | 6XHC | - | V2G | C12 H17 N6 O8 P | c1nc(c2c(n.... |
44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
45 | 1RNN | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
46 | 2XOG | Ki = 0.37 mM | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
51 | 3RID | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
53 | 1WBU | - | WBU | C4 H5 N3 O2 | C1=C(C(=O).... |
54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
55 | 4G8Y | Ki = 25.8 uM | 0FT | C13 H17 N5 O6 | CC1=CN(C(=.... |
56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
64 | 2W5L | Ki = 63 uM | NAP | C21 H28 N7 O17 P3 | c1cc(c[n+].... |
65 | 1RUV | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
69 | 2W5G | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
73 | 1TQ9 | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
78 | 3DJQ | Ki = 1046.4 uM | UDP | C9 H14 N2 O12 P2 | C1=CN(C(=O.... |
79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
No: | PDB id | Binding Data | Representative ligand | Formula | Smiles |
---|---|---|---|---|---|
The Class containing this family consists of a total of 4 families. | |||||
1 | 1Z6D | Ki = 4.6 mM | IMP | C10 H13 N4 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
2 | 1O0H | Ki = 1.2 uM | ADP | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
3 | 1JVU | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
4 | 3D7B | Ki = 203 uM | U4S | C13 H19 N3 O5 | C1CCN(C1)C.... |
5 | 3FL1 | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
6 | 6PVW | Ki = 0.48 uM | OZV | C10 H16 N5 O18 P5 | c1nc(c2c(n.... |
7 | 3D6Q | Ki = 172 uM | U3S | C14 H21 N3 O5 | C1CCN(CC1).... |
8 | 3JW1 | - | U5P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
9 | 3EV6 | - | RSF | C6 H10 O3 | C1CO[C@H]2.... |
10 | 2W5I | Ki = 0.86 uM | ATP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
11 | 3D8Y | Ki = 396 uM | T3S | C15 H23 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
12 | 3D6O | Ki = 77 uM | U1S | C17 H25 N3 O7 | CCOC(=O)C1.... |
13 | 3LXO | Kd = 15 uM | T3P | C10 H15 N2 O8 P | CC1=CN(C(=.... |
14 | 1O0O | Ki = 8 uM | A2P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
15 | 1RPF | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
16 | 3D6P | Ki = 179 uM | U2S | C13 H19 N3 O6 | C1COCCN1C[.... |
17 | 4G8V | Ki = 1.6 uM | 0EY | C12 H15 N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
18 | 1RNC | - | 5GP | C10 H14 N5 O8 P | c1nc2c(n1[.... |
19 | 4WYZ | Kd = 50 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
20 | 1ROB | - | C2P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
21 | 1W4Q | Ki = 5.5 uM | UMF | C9 H12 F N2 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
22 | 6PVV | Ki = 1.4 uM | 5FA | C10 H18 N5 O19 P5 | c1nc(c2c(n.... |
23 | 1O0F | Ki = 5 uM | A3P | C10 H15 N5 O10 P2 | c1nc(c2c(n.... |
24 | 3EV4 | - | ETF | C2 H3 F3 O | C(C(F)(F)F.... |
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29 | 6PVX | Ki = 0.068 uM | U5F | C9 H17 N2 O21 P5 | C1=CN(C(=O.... |
30 | 1RNM | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
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32 | 2G8R | Ki = 103 uM | N3E | C15 H21 N3 O7 | C1CN(CCC1C.... |
33 | 1U1B | Kd = 16 nM | PAX | C20 H27 N7 O20 P4 | CC1=CN(C(=.... |
34 | 1QHC | Ki = 27 nM | PUA | C19 H27 N7 O20 P4 | c1nc(c2c(n.... |
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37 | 1O0M | Ki = 7.1 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
38 | 2QCA | - | DGP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc2c(n1[.... |
39 | 3EV5 | - | TMO | C3 H9 N O | C[N+](C)(C.... |
40 | 4S18 | - | 1PT | C6 H14 N2 Pt | C1CC[C@@H].... |
41 | 1EOS | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
42 | 4RTE | - | CPT | Cl2 H6 N2 Pt | [NH3][Pt](.... |
43 | 6XHC | - | V2G | C12 H17 N6 O8 P | c1nc(c2c(n.... |
44 | 1W4O | Ki = 3 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
45 | 1RNN | - | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
46 | 2XOG | Ki = 0.37 mM | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
47 | 6YO1 | - | UVC | C9 H12 N2 O9 V | C1=CN(C(=O.... |
48 | 1W4P | Ki = 18 uM | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
49 | 1AFL | Ki = 520 nM | ATR | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
50 | 3EV3 | - | TBU | C4 H10 O | CC(C)(C)O |
51 | 3RID | - | CGP | C19 H25 N8 O10 P | c1nc2c(n1[.... |
52 | 1RPG | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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54 | 6QE9 | - | J9H | C17 H18 N3 Pt | Cc1ccc2ccc.... |
55 | 4G8Y | Ki = 25.8 uM | 0FT | C13 H17 N5 O6 | CC1=CN(C(=.... |
56 | 1JN4 | Ki = 11.3 uM | 139 | C19 H25 N7 O14 P2 | c1nc(c2c(n.... |
57 | 1O0N | Ki = 82 uM | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
58 | 1AFK | Ki = 240 nM | PAP | C10 H16 N5 O13 P3 | c1nc(c2c(n.... |
59 | 2XOI | Ki = 0.00046 M | SFB | C20 H28 N8 O11 S | c1nc(c2c(n.... |
60 | 1EOW | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
61 | 5OGH | - | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
62 | 5NA9 | - | QPT | C6 H12 N2 O4 Pt | C1CC2(C1)C.... |
63 | 1F0V | - | DC DG | n/a | n/a |
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66 | 1Z6S | Ki = 46 uM | AMP | C10 H14 N5 O7 P | c1nc(c2c(n.... |
67 | 4G90 | Ki = 30.8 uM | 0G0 | C12 H14 F N5 O6 | c1c(nnn1[C.... |
68 | 6F60 | - | DVW | C27 H31 N7 O5 Pt | CC1=CC=C2C.... |
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70 | 3D8Z | Ki = 423 uM | TXS | C14 H21 N3 O4 | CC1=CN(C(=.... |
71 | 5JLG | - | RU | Ru | [Ru+3] |
72 | 11BA | - | UPA | C19 H24 N7 O12 P | c1nc(c2c(n.... |
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74 | 3DJO | Ki = 40.8 uM | U2P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
75 | 1N3Z | - | U3P | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
76 | 3DJV | Ki = 27.9 uM | C3P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
77 | 1R5C | - | CPA | C19 H25 N8 O9 P | c1nc(c2c(n.... |
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79 | 3DJP | Ki = 63.2 uM | UA3 | C9 H13 N2 O9 P | C1=CN(C(=O.... |
80 | 3DJX | Ki = 1557.9 uM | C5P | C9 H14 N3 O8 P | C1=CN(C(=O.... |
81 | 11BG | - | U2G | C19 H24 N7 O13 P | c1nc2c(n1[.... |
82 | 5ARK | - | UMP | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
83 | 2RNF | - | UM3 | C9 H13 N2 O8 P | C1[C@@H]([.... |
No: | Ligand | ECFP6 Tc | MDL keys Tc |
---|---|---|---|
1 | PAX | 1 | 1 |
2 | PUA | 0.614815 | 0.938272 |
3 | 4TA | 0.613636 | 0.951219 |
4 | Z5A | 0.574468 | 0.917647 |
5 | A3P | 0.5625 | 0.85 |
6 | T5A | 0.544118 | 0.939759 |
7 | PAP | 0.533898 | 0.839506 |
8 | ADS THS THS THS | 0.517483 | 0.873563 |
9 | PPS | 0.508197 | 0.755556 |
10 | ATP A A A | 0.503817 | 0.839506 |
11 | ATP A | 0.503817 | 0.839506 |
12 | THP | 0.5 | 0.85 |
13 | 3AM | 0.495575 | 0.814815 |
14 | 0WD | 0.479167 | 0.902439 |
15 | ADP BMA | 0.476923 | 0.809524 |
16 | BEF ADP | 0.467742 | 0.807229 |
17 | APU | 0.464789 | 0.901235 |
18 | 139 | 0.458333 | 0.903614 |
19 | ADP MG | 0.45082 | 0.82716 |
20 | ADP BEF | 0.45082 | 0.82716 |
21 | ATP MG | 0.448 | 0.82716 |
22 | ADP PO3 | 0.448 | 0.82716 |
23 | ALF ADP | 0.445312 | 0.770115 |
24 | VO4 ADP | 0.445312 | 0.831325 |
25 | DU DU DU DU BRU DA DU | 0.441718 | 0.872093 |
26 | APC G U | 0.440789 | 0.823529 |
27 | COA FLC | 0.437909 | 0.782609 |
28 | 9BG | 0.432432 | 0.813953 |
29 | A | 0.428571 | 0.82716 |
30 | AMP | 0.428571 | 0.82716 |
31 | ETB | 0.427632 | 0.763441 |
32 | A2P | 0.422764 | 0.8375 |
33 | UBG | 0.422619 | 0.829545 |
34 | T3P | 0.422414 | 0.82716 |
35 | TTP MG | 0.420635 | 0.82716 |
36 | DCA | 0.418301 | 0.793478 |
37 | ATY | 0.417323 | 0.809524 |
38 | AR6 AR6 | 0.415493 | 0.829268 |
39 | COA | 0.412903 | 0.793478 |
40 | 0T1 | 0.412903 | 0.793478 |
41 | ANP MG | 0.412214 | 0.819277 |
42 | SCO | 0.411392 | 0.793478 |
43 | 3DR DT DT DT DT DT | 0.411348 | 0.819277 |
44 | KGJ | 0.411043 | 0.747475 |
45 | CCQ | 0.410714 | 0.762887 |
46 | NMN AMP PO4 | 0.410596 | 0.901235 |
47 | DT MA7 DT | 0.409938 | 0.872093 |
48 | FAM | 0.408805 | 0.776596 |
49 | BUA COA | 0.408537 | 0.765957 |
50 | TMP | 0.408333 | 0.839506 |
51 | ADP | 0.408 | 0.829268 |
52 | HAX | 0.40625 | 0.776596 |
53 | PLM COA | 0.405882 | 0.75 |
54 | DAO COA | 0.405882 | 0.75 |
55 | DKA COA | 0.405882 | 0.75 |
56 | DCR COA | 0.405882 | 0.75 |
57 | EO3 COA | 0.405882 | 0.75 |
58 | X90 COA | 0.405882 | 0.75 |
59 | MYR COA | 0.405882 | 0.75 |
60 | CAO | 0.405063 | 0.768421 |
61 | COS | 0.405063 | 0.776596 |
62 | 30N | 0.405063 | 0.73 |
63 | AMX | 0.405063 | 0.802198 |
64 | NYM | 0.404959 | 0.864198 |
65 | 6NA COA | 0.404762 | 0.75 |
66 | FYN | 0.403727 | 0.793478 |
67 | 7D5 | 0.403361 | 0.795181 |
68 | ATR | 0.403101 | 0.82716 |
69 | A22 | 0.402985 | 0.841463 |
70 | CMX | 0.402516 | 0.793478 |
71 | M7G A2M G | 0.402235 | 0.795699 |
72 | AMP MG | 0.401639 | 0.814815 |
73 | M33 | 0.401575 | 0.819277 |
74 | PO4 PO4 A A A A PO4 | 0.40146 | 0.8375 |
75 | YZS | 0.401235 | 0.708738 |
76 | COK | 0.401235 | 0.776596 |
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78 | FCX | 0.4 | 0.768421 |
79 | ACO | 0.4 | 0.768421 |
80 | AHZ | 0.4 | 0.766667 |
No: | Ligand | Similarity coefficient |
---|
This union binding pocket(no: 1) in the query (biounit: 1u1b.bio2) has 86 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
This union binding pocket(no: 2) in the query (biounit: 1u1b.bio1) has 79 residues | |||
---|---|---|---|
No: | Leader PDB | Ligand | Sequence Similarity |
1 | 2GMK | AMP | 40.3846 |