PREDICTION OF NOVEL SERINE PROTEASE INHIBITORS
PDB id Source Resolution
1TNG 1.8 angstroms
Ligand Information
Ligand Validity Binding
Data		 Ligand
Warnings		 Eolus Viewer
(click picture
to launch)		 Chemaxon
Viewer		 Molecular
Weight
(Da)		 Formula SMILES
AMC Valid Ki =  1.17 mM   launch gocavviewer-lite   114.209
C7 H16 N
 C1CCC(CC1)C[NH3+]

PREDICTION OF NEW SERINE PROTEINASE INHIBITORS. NAT.STRUCT.BIOL. V. 1 735 1994

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Leader:    1XUJ
TRYPSIN-KETO-BABIM-ZN+2, PH 8.2
PDB id Binding data Representative ligand
1XUJ Ki < 1.0 nM BOZ
1AQ7 ic50 = 0.9 uM AEB
1AZ8   IN4
1BJU Ki = 6.2 uM GP6
1BJV Ki = 13.0 uM GP8
1BTY   BEN
1C1N   BAM
1C1P   BAI
1C1Q   BAI
1C1R Ki = 0.0235 uM BAI
1C1S   BAB
1C1T   BAB
1C2D Ki = 0.0052 uM BAK
1C2E   BAK
1C2F   BAH
1C2G   BAH
1C2H   BAK
1C2I   BAK
1C2J   BAK
1C2K   ABI
1C5P Ki = 21.0 uM BAM
1C5Q Ki = 0.44 uM ESI
1C5R   ESI
1C5S Ki = 1.0 uM ESX
1C5T Ki = 80.0 uM ESP
1C5U   ESP
1CE5 Ki = 18.4 uM BEN
1EB2 Ki = 16.0 nM BPO
1F0T Ki = 1000.0 nM PR1
1F0U Ki = 69.0 nM RPR
1G36 Ki = 67.0 nM R11
1G3B Ki = 1.8 uM 108
1G3C Ki = 1.6 uM 109
1G3D Ki = 2.8 uM 108
1G3E Ki = 4.2 uM 109
1GHZ Ki = 16.0 uM 120
1GI0   BMZ
1GI1 Ki = 3.6 uM BMZ
1GI4 Ki = 0.065 uM 122
1GI6 Ki = 4.0 uM 124
1GJ6 Ki = 0.23 uM 132
1J8A   BEN
1JIR   AML
1K1I Kd = 264.0 nM FD1
1K1J Kd = 28.0 nM FD2
1K1L Kd = 125.0 nM FD3
1K1M Kd = 40.0 nM FD4
1K1N Kd = 153.0 nM CCR
1K1O   IGN
1K1P   MEL
1LQE Ki = 1507.0 nM IMA
1MTS   BX3
1MTU   BX3
1MTV   BX3
1MTW   DX9
1N6X   ABN
1N6Y   ABN
1O2H Ki = 0.068 uM CR3
1O2I Ki = 0.052 uM 655
1O2J Ki = 0.12 uM 656
1O2K Ki = 0.12 uM 656
1O2L   762
1O2N Ki = 0.81 uM 762
1O2O Ki = 0.44 uM 950
1O2P   972
1O2Q Ki = 0.021 uM 991
1O2R   CR9
1O2S Ki = 3.4 uM CR4
1O2U Ki = 1.4 uM 847
1O2V Ki = 1.4 uM 847
1O2W Ki = 1.4 uM 847
1O2X Ki = 1.4 uM 847
1O2Y Ki = 1.4 uM 847
1O2Z Ki = 0.78 uM 312
1O30 Ki = 0.17 uM 693
1O31 Ki = 1.8 uM 801
1O32 Ki = 1.8 uM 801
1O33 Ki = 1.8 uM 801
1O34 Ki = 1.8 uM 801
1O35   802
1O36 Ki = 1.1 uM 607
1O37 Ki = 0.15 uM 653
1O38 Ki = 0.15 uM 653
1O39 Ki = 0.074 uM 780
1O3B Ki = 0.074 uM 780
1O3D Ki = 0.074 uM 780
1O3E Ki = 0.011 uM 696
1O3F Ki = 0.011 uM 696
1O3G Ki = 0.011 uM 696
1O3H Ki = 0.05 uM 907
1O3I Ki = 0.05 uM 907
1O3J Ki = 0.17 uM 334
1O3K Ki = 0.17 uM 334
1O3L   678
1O3M   785
1O3N   785
1O3O   785
1OYQ Ki = 110.0 nM T87
1PPC Ki = 0.69 uM NAS-GLY-APH-PIP
1PPH Ki = 1.2 uM APM-PIP-TOS
1QA0   270
1QB1 Ki = 170.0 nM 974
1QB6 Ki = 870.0 nM 623
1QB9 Ki = 36.0 nM 806
1QBN Ki = 1400.0 nM 688
1QBO Ki = 18.0 nM 711
1QL7 Ki = 13.4 uM ZEN
1S0R   BEN
1TIO   BAM
1TNG Ki = 1.17 mM AMC
1TNH Ki = 0.43 mM FBA
1TNI Ki = 0.1 mM PBN
1TNJ Ki = 11.0 mM PEA
1TNK Ki = 32.5 mM PRA
1TNL Ki = 13.3 mM TPA
1TPS ic50 = 10.0 nM A9A
1TX7 Ki = 25.0 uM 4CM
1TX8 Ki = 1800.0 uM AM4
1UTN Kd = 0.321 mM ABN
1UTO Kd = 5.32 mM PEA
1UTP Kd = 36.0 mM PBN
1V2J Ki = 566.0 uM BEN
1V2K Ki = 0.65 uM ZEN
1V2L Ki = 51.0 uM BEN
1V2M Ki = 51.0 uM BEN
1V2N Ki = 1.25 uM BBA
1V2O Ki = 18.45 uM ANH
1V2P Ki = 18.45 uM ANH
1V2Q Ki = 73.62 uM ANH
1V2R Ki = 278.96 uM ANH
1V2S Ki = 68.0 uM BEN
1V2T Ki = 19.56 uM ANH
1V2U Ki = 427.0 uM BEN
1V2V Ki = 427.0 uM BEN
1V2W Ki = 97.79 uM ANH
1XUF Ki = 0.09 uM BAZ
1XUG Ki = 0.09 uM BAB
1XUH   BAO
1XUI   BAO
1XUK Ki = 19.0 uM BAB
1Y3V Ki = 2300.0 nM UIR
1Y3W Ki = 1680.0 nM UIP
1Y3X Ki = 7315.0 nM UIB
1Y3Y Ki = 2300.0 nM UIR
1Y59 Ki = 1.19 uM TL1
1Y5A Ki = 1.33 uM TL2
1Y5B Kd = 1.26 uM TL3
1Y5U Kd = 0.22 uM TL4
1YP9 Ki = 7700.0 nM UIZ
2AGG   SIN-ALA-ALA-PRO-LYS
2AYW   ONO
2BLV   BEN
2BLW   BEN
2BY5   BAM
2BY6   BAM
2BY7   BAM
2BY8   BAM
2BY9   BAM
2BYA   BAM
2BZA Ki = 1.58 mM ABN
2FX6 Ki = 200.0 uM 270
2G5N   23M
2G5V   22M
2G8T   MI2
2TIO   BEN
2ZDK   50U
2ZDL   45U
2ZDM   46U
2ZDN   49U
2ZFS   12U
2ZFT   10U
2ZHD   12U
2ZQ1   11U
2ZQ2 Kd = 276.0 nM 13U
3AAS Kd = 31.0 uM GUS
3AAU Ki = 9.0 uM GZC-CU
3GY2 Kd = 1.8 uM BRN
3GY3 Kd = 2.36 uM PNT
3GY4 Kd = 8.0 uM PBZ
3GY5 Kd = 1.8 uM BRN
3GY6 Kd = 1.8 uM BRN
3GY7 Kd = 30.0 uM BEN
3GY8 Kd = 1.8 uM BRN
3ITI ic50 = 0.27 uM BRV
3LJJ Kd = 300.0 nM 10U
3LJO Kd = 239.0 nM 11U
3M35   M35
3NK8   JKZ
3NKK ic50 = 8.6 uM JLZ
3PTB   BEN
3QK1   BEN
3T25   BEN
3T26   BEN
3T27   BEN
3T29   BEN