TRYPSIN-BABIM-ZN+2, PH 8.2
PDB id Source Resolution
1XUG 1.5 angstroms
Ligand Information
Ligand Validity Binding
Data
Ligand
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Eolus Viewer
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to launch)
Chemaxon
Viewer
Molecular
Weight
(Da)
Formula SMILES
BAB Valid Ki =  0.09 uM   launch gocavviewer-lite   335.386
C17 H19 N8
c1cc2c(cc1C(=[NH2+])N)[nH]c([nH+]2)Cc3[nH]c4cc(ccc4n3)C(=[NH2+])N

DESIGN OF POTENT SELECTIVE ZINC-MEDIATED SERINE PROTEASE INHIBITORS. NATURE V. 391 608 1998

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Leader:    1XUJ
TRYPSIN-KETO-BABIM-ZN+2, PH 8.2
PDB id Binding data Representative ligand
1XUJ Ki < 1.0 nM BOZ
1AQ7 ic50 = 0.9 uM AEB
1AZ8   IN4
1BJU Ki = 6.2 uM GP6
1BJV Ki = 13.0 uM GP8
1BTY   BEN
1C1N   BAM
1C1P   BAI
1C1Q   BAI
1C1R Ki = 0.0235 uM BAI
1C1S   BAB
1C1T   BAB
1C2D Ki = 0.0052 uM BAK
1C2E   BAK
1C2F   BAH
1C2G   BAH
1C2H   BAK
1C2I   BAK
1C2J   BAK
1C2K   ABI
1C5P Ki = 21.0 uM BAM
1C5Q Ki = 0.44 uM ESI
1C5R   ESI
1C5S Ki = 1.0 uM ESX
1C5T Ki = 80.0 uM ESP
1C5U   ESP
1CE5 Ki = 18.4 uM BEN
1EB2 Ki = 16.0 nM BPO
1F0T Ki = 1000.0 nM PR1
1F0U Ki = 69.0 nM RPR
1G36 Ki = 67.0 nM R11
1G3B Ki = 1.8 uM 108
1G3C Ki = 1.6 uM 109
1G3D Ki = 2.8 uM 108
1G3E Ki = 4.2 uM 109
1GHZ Ki = 16.0 uM 120
1GI0   BMZ
1GI1 Ki = 3.6 uM BMZ
1GI4 Ki = 0.065 uM 122
1GI6 Ki = 4.0 uM 124
1GJ6 Ki = 0.23 uM 132
1J8A   BEN
1JIR   AML
1K1I Kd = 264.0 nM FD1
1K1J Kd = 28.0 nM FD2
1K1L Kd = 125.0 nM FD3
1K1M Kd = 40.0 nM FD4
1K1N Kd = 153.0 nM CCR
1K1O   IGN
1K1P   MEL
1LQE Ki = 1507.0 nM IMA
1MTS   BX3
1MTU   BX3
1MTV   BX3
1MTW   DX9
1N6X   ABN
1N6Y   ABN
1O2H Ki = 0.068 uM CR3
1O2I Ki = 0.052 uM 655
1O2J Ki = 0.12 uM 656
1O2K Ki = 0.12 uM 656
1O2L   762
1O2N Ki = 0.81 uM 762
1O2O Ki = 0.44 uM 950
1O2P   972
1O2Q Ki = 0.021 uM 991
1O2R   CR9
1O2S Ki = 3.4 uM CR4
1O2U Ki = 1.4 uM 847
1O2V Ki = 1.4 uM 847
1O2W Ki = 1.4 uM 847
1O2X Ki = 1.4 uM 847
1O2Y Ki = 1.4 uM 847
1O2Z Ki = 0.78 uM 312
1O30 Ki = 0.17 uM 693
1O31 Ki = 1.8 uM 801
1O32 Ki = 1.8 uM 801
1O33 Ki = 1.8 uM 801
1O34 Ki = 1.8 uM 801
1O35   802
1O36 Ki = 1.1 uM 607
1O37 Ki = 0.15 uM 653
1O38 Ki = 0.15 uM 653
1O39 Ki = 0.074 uM 780
1O3B Ki = 0.074 uM 780
1O3D Ki = 0.074 uM 780
1O3E Ki = 0.011 uM 696
1O3F Ki = 0.011 uM 696
1O3G Ki = 0.011 uM 696
1O3H Ki = 0.05 uM 907
1O3I Ki = 0.05 uM 907
1O3J Ki = 0.17 uM 334
1O3K Ki = 0.17 uM 334
1O3L   678
1O3M   785
1O3N   785
1O3O   785
1OYQ Ki = 110.0 nM T87
1PPC Ki = 0.69 uM NAS-GLY-APH-PIP
1PPH Ki = 1.2 uM APM-PIP-TOS
1QA0   270
1QB1 Ki = 170.0 nM 974
1QB6 Ki = 870.0 nM 623
1QB9 Ki = 36.0 nM 806
1QBN Ki = 1400.0 nM 688
1QBO Ki = 18.0 nM 711
1QL7 Ki = 13.4 uM ZEN
1S0R   BEN
1TIO   BAM
1TNG Ki = 1.17 mM AMC
1TNH Ki = 0.43 mM FBA
1TNI Ki = 0.1 mM PBN
1TNJ Ki = 11.0 mM PEA
1TNK Ki = 32.5 mM PRA
1TNL Ki = 13.3 mM TPA
1TPS ic50 = 10.0 nM A9A
1TX7 Ki = 25.0 uM 4CM
1TX8 Ki = 1800.0 uM AM4
1UTN Kd = 0.321 mM ABN
1UTO Kd = 5.32 mM PEA
1UTP Kd = 36.0 mM PBN
1V2J Ki = 566.0 uM BEN
1V2K Ki = 0.65 uM ZEN
1V2L Ki = 51.0 uM BEN
1V2M Ki = 51.0 uM BEN
1V2N Ki = 1.25 uM BBA
1V2O Ki = 18.45 uM ANH
1V2P Ki = 18.45 uM ANH
1V2Q Ki = 73.62 uM ANH
1V2R Ki = 278.96 uM ANH
1V2S Ki = 68.0 uM BEN
1V2T Ki = 19.56 uM ANH
1V2U Ki = 427.0 uM BEN
1V2V Ki = 427.0 uM BEN
1V2W Ki = 97.79 uM ANH
1XUF Ki = 0.09 uM BAZ
1XUG Ki = 0.09 uM BAB
1XUH   BAO
1XUI   BAO
1XUK Ki = 19.0 uM BAB
1Y3V Ki = 2300.0 nM UIR
1Y3W Ki = 1680.0 nM UIP
1Y3X Ki = 7315.0 nM UIB
1Y3Y Ki = 2300.0 nM UIR
1Y59 Ki = 1.19 uM TL1
1Y5A Ki = 1.33 uM TL2
1Y5B Kd = 1.26 uM TL3
1Y5U Kd = 0.22 uM TL4
1YP9 Ki = 7700.0 nM UIZ
2AGG   SIN-ALA-ALA-PRO-LYS
2AYW   ONO
2BLV   BEN
2BLW   BEN
2BY5   BAM
2BY6   BAM
2BY7   BAM
2BY8   BAM
2BY9   BAM
2BYA   BAM
2BZA Ki = 1.58 mM ABN
2FX6 Ki = 200.0 uM 270
2G5N   23M
2G5V   22M
2G8T   MI2
2TIO   BEN
2ZDK   50U
2ZDL   45U
2ZDM   46U
2ZDN   49U
2ZFS   12U
2ZFT   10U
2ZHD   12U
2ZQ1   11U
2ZQ2 Kd = 276.0 nM 13U
3AAS Kd = 31.0 uM GUS
3AAU Ki = 9.0 uM GZC-CU
3GY2 Kd = 1.8 uM BRN
3GY3 Kd = 2.36 uM PNT
3GY4 Kd = 8.0 uM PBZ
3GY5 Kd = 1.8 uM BRN
3GY6 Kd = 1.8 uM BRN
3GY7 Kd = 30.0 uM BEN
3GY8 Kd = 1.8 uM BRN
3ITI ic50 = 0.27 uM BRV
3LJJ Kd = 300.0 nM 10U
3LJO Kd = 239.0 nM 11U
3M35   M35
3NK8   JKZ
3NKK ic50 = 8.6 uM JLZ
3PTB   BEN
3QK1   BEN
3T25   BEN
3T26   BEN
3T27   BEN
3T29   BEN